HE Weiyue

Nationalité: Chine
Contact : weiyue.he@inrae.fr

Sujet de thèse

Adaptation épigénétique de la vigne aux défis environnementaux.

• Ecole doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé - Université de Bordeaux
• Direction : Philippe GALLUSCI
• Financement : Plant2Pro
• Projet : CloneAdapt
• Période : 10/10/2025 - 09/10/2028

Résumé

Le changement climatique fait peser de nombreuses menaces sur l'agriculture, notamment la viticulture, en générant divers types de stress intense pour les plantes. En viticulture, diverses stratégies ont été développées pour atténuer ces effets, notamment l'adaptation des pratiques viticoles, mais aussi la sélection de nouveaux cépages et/ou porte-greffes mieux adaptés aux stress environnementaux. De plus, des données récentes suggèrent que l'épigénétique, qui désigne les modifications héréditaires du fonctionnement du génome, indépendantes des variations de séquence d'ADN, favorise l'adaptation des plantes à leur environnement. Dans ce contexte, la vigne, une plante vivace greffée et reproduite par clonage, offre l'opportunité d'explorer comment les mémoires épigénétiques parentales, induites par l'environnement, peuvent servir de moteur à l'adaptation rapide à l'environnement des descendants ainsi reproduits. Dans le cadre du projet proposé, nous étudierons comment des plantes reproduites par bouturage asexué à partir des mêmes pieds mères, mais cultivées dans des environnements contrastés, ont évolué aux niveaux physiologique et moléculaire. Nous explorerons l'influence des conditions environnementales sur les phénotypes des plantes et leurs corrélations avec les changements moléculaires, notamment les programmes d'expression génique, les populations de petits ARN et l'information épigénétique. Ces plantes seront ensuite utilisées pour générer une nouvelle population afin d'évaluer l'hérédité des variations épigénétiques induites par l'environnement par propagation asexuée et ses conséquences sur les réponses des plantes aux stress contrôlés. L'objectif principal de ce travail est d'évaluer comment la diversité épigénétique induite par l'environnement peut contribuer à la résilience des plantes sous stress, et d'étudier la stabilité des empreintes épigénétiques parentales pendant la propagation des plantes. Ceci sera réalisé en utilisant la vigne, une plante pérenne greffée et propagée par clonage, d'une importance économique majeure. Le stress des plantes parentales pour générer des populations de jeunes plants mieux adaptés est une voie prometteuse qui doit être évaluée en profondeur afin de déterminer la stabilité des empreintes épigénétiques parentales au fil du temps, ainsi que leurs conséquences sur la résilience de la plante au stress. Il vise à explorer de nouvelles approches pour accroître la résilience des plantes au stress, limitant ainsi l'impact de la viticulture sur l'environnement. Plus fondamentalement, nous étudierons comment l'environnement affecte l'épigénome des plants de vigne et quelle partie de ces changements épigénétiques est transmise à la génération suivante après la propagation asexuée et pourrait être impliquée dans l'adaptation des plantes à leur environnement.